报告题目:Multi-scale modeling of 3-D chromatin structures
报 告 人 :高毅勤教授
报告时间:2018年1月17日(周三)上午9:00
报告地点:化学楼一号会议室
邀 请 人:杨利明教授
报告人简介:
高毅勤,北京分子科学国家研究中心副主任。北京大学化学与分子工程学院院长,教育部“长江学者”特聘教授,北京大学生物动态光学成像中心研究员,国家杰出青年科学基金获得者。1993年本科毕业于四川大学化学系,1996年在中科院化学所获得硕士学位, 2001年获得加州理工学院博士学位。2001年-2004年间在加州理工学院和哈佛大学做博士后研究。2005年-2009年,美国得克萨斯农工大学化学系助理教授。2010-现今,北京大学化学与分子工程学院教授。他的研究领域是理论和计算化学。致力于发展理论与计算方法研究染色质结构和生物功能,生物分子的溶液构象,生物酶催化机制和化学反应中的溶剂化效应。已在Science, Cell, PNAS, JACS等杂志发表SCI论文100余篇。在国际和国内学术会议上和科研机构做大会和邀请报告150余次。曾获Pople Medal, 日本化学会Keynote Lecturer奖,美国Searle Scholar,Dreyfus新教授奖和Clauser Prize等。担任ACS Central Science, Chemistry of Materials, Journal of Chemical Physics,Interdisciplinary Sciences, 物理化学学报等期刊的编委。
报告摘要:
Chromosome structure is essential in many biological studies. Recent Hi-C experimental studies have been dramatically deepening our understanding of the 3D chromatin. In this talk, we describe the modelling of the chromatin structure utilizing experimental Hi-C data, which provides the spatial details of chromatin. By mapping a plethora of genome features onto the chromatin model, we quantitatively and systematically reinforce the importance of chromatin architecture for genome function. We find that the colocalization of genome features on a linear map coincides their 3D segregation, and thus the latter provides a mechanism for the regulation of various genome properties. Especially, we will discuss the effects of DNA methylation on the structure of DNA and that the overall DNA methylation patter reflects the 3-D organization of the human chromatin.